1890年７月のことである。セザール・フランクが乗車していた辻馬車が馬引き列車と衝突事故を起こした。頭に損傷を受けた彼は一時意識不明になる。後遺症が見られなかったため、この事故を重要視しなかった。しかしながら次第に歩行が苦痛になり始め、気が付くと彼は演奏会やリハーサルを休まなくてはならない状態になった。さらに音楽院での講義もできなくなり、急いで休暇を取った。1890年８月〜９月に書き上げられた「３つのコラール」は、バッハを意識したフランクが自作したコラールで、この作品はバッハ以来のオルガンの名曲と称されるオルガン音楽史における珠玉の逸品だといわれています。「コラール第１番ホ長調」は、フランクらしい、美しいけれどせつない主題から始まり、バッハを思わせるオクターブストップを使った多声和音が突然出てきて、驚かされます。フランクがカヴァイエ=コルの手による〝シンフォニック・オルガン〟で真の音楽を追求する魅力に取り憑かれた頃、フランツ・リストは55歳で一転、聖職者になり、宗教音楽を多く手掛けるようになりました。パイプオルガンのために作曲された、《コラール『アド・ノス・アド・サルタレム・ウンダム』による幻想曲とフーガ》もその一つです。リストはカトリックですので、ルターの宗教改革に基づくものではなく、バッハのコラール作品と比較できるものではないですが、伝統的形式、様式は継承しつつ、その音楽性は、ロマン派です。オルガン独奏曲の中でも最大規模の作品で、実質８小節の単一主題をもとに約30分、全三部の音楽を作り出す、主題変容の一つの極致のような作品です。主題となるのはマイアベーアのオペラ「預言者（Le prophète）」の第１幕、３人のアナバプティスト（再洗礼派）が登場して農民たちをオルグしていく場面で歌うラテン語の聖歌です。彼らを含むアナバプティストたちは主人公のジャンを（偽）預言者にいただいて貴族へ反乱を起こす、劇の中でも重要な役割を担っていますが、彼らが善良な存在ではないことを思い起こさせる重苦しい主題から始まる。ほとんど調性が安定することなくひたすらに転調と不協和音を多用した主題の変容を続けていきます。高らかなファンファーレも登場し、やがて、ピアノ曲でおなじみの『愛の夢』を思わせる、ここまでの激しい展開とはまったく性格の異なる、天国的な響きを聴かせます。甘いアルペジオは最終的に変イ長調の和音で断ち切られ、最後のフーガは、コラールのテーマが、リズミカルに処理されていく、聴く者に期待を持たせ、弾くものを絶望に陥れます。転調を繰り返し、遠く離れた嬰へ短調で573小節からのクライマックスを築くと、嬰へ長調となって第一部のファンファーレ楽想が登場し、早いパッセージが途切れることなく、切迫感の中で展開していきます。ハ短調に嬰へ長調やロ長調が対置され、調の対立は激化します。コーダでは待ちに待ったハ長調、再強奏で主題が登場。大詰めはドミナントを通らずサブドミナント方面に響きが振れて、プラガル終止で荘厳に曲を閉じます。これはリストが本格的にフーガを作品へ取り入れた最初の例ですが、不協和音程が頻発する型破りな書き方で、こうしたリストのフーガの捉え方は、若い頃に教えを受けたアントワーヌ・ライヒャも型破りな考え方の作曲家だった影響を受けたのではないかと指摘されています。ピアノ曲とは一味違うリストのオルガン曲でも、ロマン派の巨匠ならではの大傑作です。